Kolegium Jezuickie, którym kierował, było jednym z najważniejszych ośrodków edukacyjnych w Rzeczypospolitej. Nauczano tam zarówno przedmiotów klasycznych, jak i teologii, a jego działalność wywarła długofalowy wpływ na rozwój szkolnictwa w Polsce. Edukacja pod kierownictwem jezuitów charakteryzowała się wysokim poziomem nauczania, co pozwoliło wielu absolwentom na zajmowanie znaczących stanowisk w administracji państwowej i kościelnej.
Skarga był nie tylko pedagogiem, ale także aktywnym kaznodzieją, który zyskał ogromną popularność dzięki swoim płomiennym przemówieniom. Jego działalność kaznodziejska w kościołach oraz na dworze królewskim przyczyniła się do szerzenia idei kontrreformacji i umacniania pozycji katolicyzmu w Polsce. „Kazania sejmowe” Skargi stanowiły jedną z najbardziej wpływowych publikacji religijno-politycznych tamtej epoki, w których ostrzegał przed podziałami religijnymi oraz demoralizacją szlachty.
Piotr Skarga był także orędownikiem pomocy ubogim i potrzebującym. Zainicjował działalność licznych bractw charytatywnych, które zajmowały się wsparciem społecznym i edukacyjnym. Jego koncepcja społeczeństwa oparta na silnej moralności i lojalności wobec Kościoła miała na celu wzmocnienie struktury państwa.
Dziedzictwo Piotra Skargi pozostaje istotnym elementem historii Poznania, a jego wkład w rozwój edukacji i myśli politycznej jest doceniany do dziś. Jego działalność pedagogiczna i kaznodziejska miała ogromny wpływ na rozwój intelektualny ówczesnej Polski, a Kolegium Jezuickie w Poznaniu odegrało kluczową rolę w kształceniu elit Rzeczypospolitej.